Dự án cầu đường sắt Bình Lợi mới qua sông Sài Gòn được triển khai trong điều kiện tương đối phức tạp, vừa thi công vừa đảm bảo giao thông tuyến đường sắt Bắc–Nam đang vận hành khai thác.
Các đơn vị đã thống nhất bảo tồn nguyên trạng hai nhịp cầu giáp bờ phía quận Thủ Đức, trong đó có một nhịp cầu quay và một tháp canh đầu cầu phía quận Thủ Đức.
Bộ Giao thông vừa có Kết luận thanh tra chỉ rõ nhiều tồn tại, sai sót tại dự án đầu tư xây công trình cải tạo, nâng cấp luồng sông Sài Gòn từ cầu đường sắt Bình Lợi tới cảng Bến Súc theo hợp đồng BOT.