Trong phiên tòa, Phùng Anh Lê không cung cấp thêm các chứng cứ mới liên quan đến nội dung vụ án, do đó, Tòa phúc thẩm không chấp nhận kháng cáo của bị cáo, giữ nguyên bản án sơ thẩm 7 năm 6 tháng tù.
Hội đồng xét xử kiến nghị Công an thành phố Hà Nội và Cơ quan điều tra Viện KSND Tối cao tiếp tục xem xét, xác minh làm rõ trách nhiệm các cá nhân có dấu hiệu của tội “Đưa hối lộ,” “Môi giới hối lộ.”
Bị cáo Phùng Anh Lê cho rằng mình bị oan sai, bị cáo không nhận tiền hối lộ, nhưng HĐXX nhận định việc truy tố bị cáo là đúng người, đúng tội, tuyên án bị cáo Lê 7 năm 6 tháng tù về tội “Nhận hối lộ”.
Theo công tố viên, bị cáo Phùng Anh Lê có động cơ vụ lợi, chỉ đạo tha người không đúng quy định của pháp luật, nên cần thiết phải xử phạt nghiêm khắc với mức án cao nhất trong số các bị cáo của vụ án.
Bị cáo Phùng Anh Lê tiếp tục khai không biết sự việc của Nguyễn Hữu Tài, không thỏa thuận, không nhận tiền từ ông Bảy và đề nghị Hội đồng xét xử đình chỉ xét xử vụ án nhận hối lộ, trả tự do cho mình.
Các bị cáo Nguyễn Đức Châu, Vũ Công Ngọc, Lê Đình Trung bị xác định là mặc dù biết chỉ đạo của Phùng Anh Lê là trái pháp luật nhưng vẫn chấp hành, thực hiện việc tha trái pháp luật với Nguyễn Hữu Tài.
Viện Kiểm sát Nhân dân Tối cao đã truy tố bị can Phùng Anh Lê, cựu trưởng Công an quận Tây Hồ, cựu trưởng Phòng cảnh sát kinh tế Công an Hà Nội, về tội danh "Nhận hối lộ."
