Mặc dù là phế tích nhưng Phật viện Đồng Dương là phức hợp các yếu tố lịch sử, văn hóa, tôn giáo, kiến trúc đô thị, tín ngưỡng, điêu khắc... nên cần được gìn giữ mọi vết tích, thành phần.
Thủ tướng Chính phủ đã quyết định xếp hạng di tích quốc gia đặc biệt đối với 13 di tích, nâng tổng số di tích quốc gia thuộc diện này trong cả nước lên 86 di tích.