Nguồn kinh phí được trích từ nguồn dự toán chi sự nghiệp y tế thuộc ngânsách trung ương năm 2009 Quốc hội đã quyết định nhưng chưa phân bổ.
Ngày 28/5/2009, Thủ tướng Chính phủ đã ban hành Quyết định số 680/QĐ-TTgbổ sung dự toán ngân sách nhà nước năm 2009 để phòng chống dịch cúm A/H1N1 ởngười.
Theo đó, Thủ tướng Chính phủ quyết định bổ sung hơn 140 tỷ đồng từ nguồndự toán chi sự nghiệp y tế thuộc ngân sách trung ương năm 2009 đã được Quốc hộiquyết định để mua sắm trang thiết bị, phương tiện y tế, thuốc, hóa chất, vật tưphục vụ công tác phòng, chống dịch cúm A/H1N1 ở người.
Ngày 15/10/2009, Thủ tướng Chính phủ có Quyết định 1603/QĐ-TTg về việc bổsung dự toán ngân sách năm 2009 để phòng, chống dịch cúm A/H1N1.
Theo đó, Thủ tướng đồng ývới đề nghị của Bộ Tài chính bổ sung 594 tỷ 150 triệu đồng cho 47 tỉnh, thànhphố trực thuộc Trung ương (538 tỷ 900 triệu đồng) và các bộ, ngành trung ương(55 tỷ 250 triệu đồng) có đề nghị xem xét hỗ trợ kinh phí phòng, chống dịch cúmA/H1N1.
Đồng thời, thủ tướng giao Bộ Tài chính chủ trì, phối hợp với Bộ Y tế xemxét, xử lý việc bổ sung kinh phí phục vụ phòng, chống dịch cúm A/H1N1 đối với 16địa phương còn lại có được đề nghị./.